From 재단법인 게놈연구재단

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균류와 박테리아 유전체 시퀀싱

Microbial Genome Sequencing


미생물은 38억년 이상 진화했고, 지구의 바이오매스의 중요한 부분을 차지합니다. 미생물의 능력에 관한 광범위한 지식은 건강, 환경, 에너지, 산업적 응용에 지대한 영향을 미칠 수 있습니다. NGS 기술과 강력한 생정보 플랫폼을 사용해 우수한 미생물 유전체 시퀀싱 서비스를 제공합니다.

Icon.png실험과정

Microbial Genome1.png 

Icon.png생정보 분석
Microbial Genome2.png 

Icon.png응용

Icon2.png기능성 유전자 연구
Icon2.png진화론적 비교 연구
Icon2.png신약 연구와 개발
Icon2.png산업과 농업 분야에서의 응용


Icon.png강점

Icon2.png대용량 시퀀싱 플랫폼
Icon2.png엄격한 라이브러리, 데이터의 QC
Icon2.png고객 맞춤 생정보 분석
Icon2.png경제적인 비용과 최단 처리기간

Icon.png프로젝트 솔루션
Microbial Genome3.png

메타지노믹스 해독


메타지노믹스는 전체 미생물 군집의 유전체를 연구하는 학문입니다. 이는 한 종류의 박테리아 유전체를 연구하는 것보다 더 많은 장점이 있습니다. 대체로 미생물은 군집을 이루고 있으며, 메타지노믹스 연구는 단일 미생물 종이 아니라 전체 미생물 군집의 유전체 시퀀싱에 초점을 맞췄기 때문에 한 종의 미생물을 따로 분리 동정할 필요가 없습니다.
현재, 메타지노믹스에서 사용하는 시퀀싱 전략은 두 가지 입니다: Sanger 시퀀싱 방법을 기반으로 하는 16S rDNA 시퀀싱 분석과 NGS 기술을 사용한 메타지노믹스(또는 메타전사체) 입니다. 전자는 일반적인 계통학적 분류는 가능하나 미생물 군집에서 종 기원을 추적하거나 유전자 기능의 다양성의 특징을 완벽히 규명할 수는 없습니다. 후자는 NGS를 통해 종 클러스터 분석, 유전자 기능 분석, 연관 분석 등의 연구를 분자 수준으로 더 많이 제공합니다.


Icon.png응용
계통학적 분류, 종 분석 & 특정 환경의 미생물 군집 다양성 평가
Icon2.png토양, 수질, 대기, 슬러지(sludge), 퇴적물
Icon2.png위장관, 기도, 구강, 요로, 질
Icon2.png곤충의 소화관, 반추위(소의 제1위)
Icon2.png내생균근(Endotrophic mycorrhiza)

Icon.png장점
Microbial Genome4.png 


Icon.png생정보 컨텐츠와 실험 과정

16S rDNA 시퀀싱  전장 메타지놈 시퀀싱

Icon2.png데이터베이스에서 이러한 태그를 정렬시킴으로써 종 동정      

Icon2.png클러스터링 거리 기반 OUT 분석
Icon2.png종 (또는 OUT) 다양성 분석
Icon2.png계통형 분석
Icon2.png여러 샘플 비교 분석


Icon2.png유전자 예측

Icon2.pngORFs의 기능적 해석
Icon2.png예측된 ORFs의 KEGG 경로 규명
Icon2.png예측된 ORFs의 계통형 지정
Icon2.png메타지노믹스 프로파일링 분석

 Microbial genome8.png