From 재단법인 게놈연구재단

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CHlP-Seq 해독

염색질 면역침강으로 단백질에 결합된 DNA 서열을 분리해낸 후 차세대 시퀀싱 기술을 통해 시퀀싱하는것(ChIP Sequencing)은 유전체 전 범위의 DNA 결합 단백질, 히스톤 변형, 뉴클레오솜을 프로파일링할 수 있습니다. ChIP 시퀀싱은 어레이 기반의 ChIP-chip보다 고해상도, 고정밀도, 많은 정보를 제공합니다.



 Epigenome1.png Icon.png응용

Icon2.png분자 육종:
식물 영양 연구; 형질전환 클론과 가축
Icon2.png인간 질병과 건강:
후성유전적 바이오마커; 진단과 치료; 후성유전적 메커니즘과 노화


Icon.png강점
Icon2.pngDNA와 단백질의 상호작용을 전장 유전체 범위에서 연구


Icon.png연구
Icon2.png이 연구는 옥수수의 전장 유전체 조사와 기관 특이적 전사물로 후성 유전적 표지 조사를 접목시켜 이루어졌습니다. 옥수수는 반복서열이 많고 큰 유전체를 지닌 식물이지만 Illumina/Solexa 1G 시퀀싱으로 매우 높은 정확성을 보이는 리드 지도가 작성되었습니다. 이 연구를 디딤돌 삼아 미래에 이와 유사한 복잡한 유전체를 연구할 때 도움이 될 것입니다.


Bisulfite-Seq 해독

Bisulfite Sequencing은 균등한 유전체 커버리지 때문에 후성유전체 연구에 있어서 가장 표준적인 연구 방법입니다. DNA에 Bisulfite 처리 한 후의 시퀀싱은 매우 정확한 시토신 메틸롬 지도 작성 완료와 단일 염기 수준의 해상도로 분석이 가능합니다.


Icon.png응용
Icon2.png메틸롬 자원:
세포주의 메틸롬 지도, 다른 종의 특정 조직
Icon2.png분자 육종:
식물 영양 연구; 형질전환 클론과 가축
Icon2.png인간 질병과 건강:
후성유전적 바이오마커; 진단과 치료; 후성유전적 메커니즘과 노화


Icon.png강점
Icon2.png단일 염기 해상도 수준의 메틸롬 개발


Icon.png연구
Icon2.png곤충의 후성유전학 이해에 도움이 되고, 앞으로 누에나 그 밖에 다른 곤충들의 후성유전적 유전자 조절을 연구하는  데 매우 유용할 것입니다. 프로젝트의 일환으로, 전장 유전체 bisulfite 시퀀싱을 통해 사람의 말초혈액단핵구(PBMCs)의 메틸롬을 완성합니다.


 Epigenome2.png

MeDIP-seq 해독


Icon.png설명
Icon2.png전장 유전체 DNA 메틸화 연구에서 메틸화된 DNA 면역침강반응 (MeDIP)은 DNA 메틸롬 연구에 비용이 효율적이고 차세대 시퀀싱 기술을 결합할 수 있는 Enrichment 기반 방법입니다.


Icon.png응용
Icon2.png응용분자 육종:
식물 영양 연구; 형질전환 클론 및 가축
Icon2.png인간의 질병과 건강:
후성유전적 바이오마커; 진단과 치료; 후성유전적 메커니즘과 노화


Icon.png강점
Icon2.pngDNA 메틸롬 연구를 위한 Enrichment 기반 전


Epigenome3.png