From 재단법인 게놈연구재단

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전 세계 게놈 연구 기관 소개

  2013년은 인간게놈프로젝트(Human Genome Project, HGP) 완료 10주년이 되는 해입니다. HGP 시작 당시, 생어시퀀싱에 의해 서열 하나하나를 살펴보던 기술에서, 차세대서열해독기술(Next Generation Sequencing, NGS)까지 해독 기술의 획기적인 발달은 극적으로 비용을 절감시키고 해독 기간을 단축 시킴으로써 게놈 연구 활성화에 큰 영향을 미쳤습니다. 이번 호에는 이런 기술적 발달에 따라 활발히 진행되고 있는 게놈 연구에 대해 전 세계 어떤 기관들이 수행하고 있는지를 알아보았습니다.


1. Wellcome trust sanger institute


  영국의 자선단체인 Wellcome Trust의 지원을 받고 있는 생어연구소는 세계 최대의 게놈 연구소로, 생어 시퀀싱 방법을 이용한 다양한 게놈 해독과 기능 규명 등 전 세계 게놈연구의 선두에 있습니다. HGP에 가장 큰 기여를 하였으며, 게놈 정보 생산 및 분석에 필요한 생물정보 분석 소프트웨어와 데이터 베이스 개발에 크게 기여 하였습니다. 생어연구소는 게놈연구 뿐 아니라, 다양한 컨텐츠를 통해 대중에게 게놈에 대한 다양한 정보를 제공하고 있습니다.


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                      (자료출처 : http://www.sanger.ac.uk/)


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                    (자료출처 : http://www.yourgenome.org/)


2. EBI(European Bioinformatics Institute)


  유럽분자생물실험실(EMBL) 산하 기관으로, 핵산, 단백질서열, 거대 분자 구조에 대한 데이터베이스를 관리하며, 생물정보학에 관한 연구 수행 및 정보를 제공하고 있습니다.


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                     (자료출처 : http://www.ebi.ac.uk/)



3. DDBJ(DNA Data Bank of Japan)


  일본 국립유전학 연구소(National Institute of Genetics)산하 기관으로 유럽의 EMBL, 미국의 NCBI와 함께 DNA 염기서열 데이터 베이스를 구축하여 이를 연구자에게 제공하고 있습니다. 그 외에 자체 데이터베이스 구축과 연구를 위한 능동적 시스템을 보유하고 있습니다.


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                      (자료출처 : http://www.ddbj.nig.ac.jp/)



4. BGI(Beijing Genomics Institute)


  1999년 설립된 베이징 게놈 연구소로 대규모 연구인력(약 5,000명)과 연구시설(NGS 해독기 180여대)을 보유함으로써, 세계적으로 대규모의 게놈 해독과 분석이 가능한 기반을 구축하였습니다. SOAP de novo 등 자체적 유전정보 분석 알고리즘을 개발하였으며, 자이언트 판다, 오이 등 다양한 생물의 유전체 지도를 완성하였습니다. 현재 자체적으로 100 양후안밍 프로젝트, 1000 식물 전사체 해독 프로젝트 등 다양한 대형 프로젝트를 진행하고 있습니다.


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                    (자료출처 : http://www.genomics.cn/en/index)



5. NCBI(National Center for Biotechnology Information)


  전 세계에서 게놈연구에 투자를 가장 많이 하는 나라인 미국에서 국가 차원의 게놈 관리 기관인 미 국가 생명공학정보센터(NCBI)는 전 세계 생물종 게놈 데이터가 모이는 세계 최대의 생명정보 기관입니다. 전 세계 게놈 데이터들을 보아 방대한 DB를 구축하고 이를 바탕으로 BLAST 서열 검색 등 유전정보를 활용 할 수 있도록 프로그램을 제공하고 있습니다.


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                     (자료출처 : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)

저자

 

글 : Jeong.YK

편집 : Park.HJ

키워드 : Wellcome trust sanger institute, EBI(European Bioinformatics Institute), DDBJ(DNA Data Bank of Japan), BGI(Beijing Genomics Institute), NCBI(National Center for Biotechnology Information)  등